L'Accademia Pontaniana è ospitata negli ambienti della Società Nazionale di Scienze Lettere e Arti in Napoli e, in particolare, nei locali nell'ex convento gesuitico, attuale palazzo universitario a via Mezzocannone.

Per uno studio su tali ambienti e la lettura storica dei relativi restauri e trasformazioni,  oltrechè, per  notizie approfondite sulla presenza, nel complesso universitario, delle due prestigiose accademie napoletane si veda il saggio G. PUGLIANO, Per la Storia della sede della Società Nazionale di Scienze, Lettere e Arti in Napoli (I), in "Atti dell'Accademia Pontaniana", LV, 2006, pp. 323-338 e G. PUGLIANO, Per la Storia della sede della Società Nazionale di Scienze, Lettere e Arti in Napoli (II), in "Atti dell'Accademia Pontaniana", LVI, 2008, pp. 265-316